• 主页
  • 课程

    关于课程

    • 课程归档
    • 成为一名讲师
    • 讲师信息
    同等学历教学

    同等学历教学

    免费
    阅读更多
  • 特色
    • 展示
    • 关于我们
    • 问答
  • 事件
  • 个性化
  • 博客
  • 联系
  • 站点资源
    有任何问题吗?
    (00) 123 456 789
    weinfoadmin@weinformatics.cn
    注册登录
    恒诺新知
    • 主页
    • 课程

      关于课程

      • 课程归档
      • 成为一名讲师
      • 讲师信息
      同等学历教学

      同等学历教学

      免费
      阅读更多
    • 特色
      • 展示
      • 关于我们
      • 问答
    • 事件
    • 个性化
    • 博客
    • 联系
    • 站点资源

      未分类

      • 首页
      • 博客
      • 未分类
      • R语言——绘图之Gene Ontology图

      R语言——绘图之Gene Ontology图

      • 发布者 weinfoauthor
      • 分类 未分类
      • 日期 2019年10月16日
      • 评论 0评论

      Gene Ontology 即基因本体(GO)是一个在生物信息学领域中广泛使用的概念,它涵盖生物学的三个方面:生物过程(Biological process,BP)、细胞组分(cellular component,CC)、分子功能(Molecular function,MF)。

       

      GO图在很多生物医学sci文章中都有展示,今天给大家展示其中呈现方式,柱状图,先看看效果图:

      img

       

      下面开始进入今天的学习内容

      img

      用excel打开go.csv文件,看看go数据概况(这里啰嗦一下我每次写推文尽量都是先展示我们要处理的原始文件的数据框架,方便大家拓展至其它专业方向待处理的数据集,而不是仅仅拘泥于此GO数据)。该文件的框架如下:

      img

      如上图所示,我们今天要处理的18个go term, 前六行BP term,中间六行CC term,最后6行MF term。

       

      怎么用柱形图展示GO三组分类,且每一个条目(Term)的Gene Count数?

       

      img

       

      
      

       

      即可得到最终图形:

      img

      由此画出的图是可以放在sci论文中的

      img

      测试文件go.csv文件已经上传到百度网盘,链接:https://pan.baidu.com/s/1zPbuI35zvR5PYJm4LWhBxw 密码:b042

      请关注“恒诺新知”微信公众号,感谢“R语言“,”数据那些事儿“,”老俊俊的生信笔记“,”冷🈚️思“,“珞珈R”,“生信星球”的支持!

      • 分享:
      weinfoauthor
      weinfoauthor

      1233

      上一篇文章

      R语言-热图(heatmap)
      2019年10月16日

      下一篇文章

      TCGA癌症类型和样本代号解析
      2019年10月17日

      你可能也喜欢

      2-1675088548
      lncRNA和miRNA生信分析系列讲座免费视频课和课件资源包,干货满满
      30 1月, 2023
      9-1675131201
      如何快速批量修改 Git 提交记录中的用户信息
      26 1月, 2023
      8-1678501786
      肿瘤细胞通过改变CD8+ T细胞中的丙酮酸利用和琥珀酸信号来调控抗肿瘤免疫应答。
      7 12月, 2022

      留言 取消回复

      要发表评论,您必须先登录。

      搜索

      分类

      • R语言
      • TCGA数据挖掘
      • 单细胞RNA-seq测序
      • 在线会议直播预告与回放
      • 数据分析那些事儿分类
      • 未分类
      • 生信星球
      • 老俊俊的生信笔记

      投稿培训

      免费

      alphafold2培训

      免费

      群晖配置培训

      免费

      最新博文

      Nature | 单细胞技术揭示衰老细胞与肌肉再生
      301月2023
      lncRNA和miRNA生信分析系列讲座免费视频课和课件资源包,干货满满
      301月2023
      如何快速批量修改 Git 提交记录中的用户信息
      261月2023
      logo-eduma-the-best-lms-wordpress-theme

      (00) 123 456 789

      weinfoadmin@weinformatics.cn

      恒诺新知

      • 关于我们
      • 博客
      • 联系
      • 成为一名讲师

      链接

      • 课程
      • 事件
      • 展示
      • 问答

      支持

      • 文档
      • 论坛
      • 语言包
      • 发行状态

      推荐

      • iHub汉语代码托管
      • iLAB耗材管理
      • WooCommerce
      • 丁香园论坛

      weinformatics 即 恒诺新知。ICP备案号:粤ICP备19129767号

      • 关于我们
      • 博客
      • 联系
      • 成为一名讲师

      要成为一名讲师吗?

      加入数以千计的演讲者获得100%课时费!

      现在开始

      用你的站点账户登录

      忘记密码?

      还不是会员? 现在注册

      注册新帐户

      已经拥有注册账户? 现在登录

      close
      会员购买 你还没有登录,请先登录
      • ¥99 VIP-1个月
      • ¥199 VIP-半年
      • ¥299 VIP-1年
      在线支付 激活码

      立即支付
      支付宝
      微信支付
      请使用 支付宝 或 微信 扫码支付
      登录
      注册|忘记密码?