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      • 基于Centos8的R语言多版本安装

      基于Centos8的R语言多版本安装

      • 发布者 weinfoeditor
      • 分类 未分类
      • 日期 2021年7月23日
      • 评论 0评论

      trt

      这些说明描述了如何从 Linux 服务器上的预编译二进制文件安装 R。

      你需要安装多个版本的 R 吗?

      我们推荐的 R 安装说明允许您提供多个版本的 R,并避免在更新系统包时替换现有的 R 版本。

      安装所需的依赖项#

      要为 R 安装必要的运行时依赖项,您需要使用以下命令为第三方或源包启用其他存储库:RHEL/CentOS 8RHEL 8

      # Enable the Extra Packages for Enterprise Linux (EPEL) repository
      sudo yum install https://dl.fedoraproject.org/pub/epel/epel-release-latest-8.noarch.rpm
      
      
      # Enable the PowerTools repository
      sudo dnf install dnf-plugins-core
      sudo dnf config-manager --set-enabled powertools
      

      CentOS 8RHEL/CentOS 7Ubuntu/DebianSUSE 12

      指定 R 版本#

      定义要安装的 R 版本。此环境变量将在以下所有步骤中使用。您可以通过在此步骤中指定所需版本来安装不同版本的 R。

      终端

      $ export R_VERSION=4.0.5
      

      R 的可用版本

      下载并安装 R#

      下载并安装所需版本的 R.

      $ curl -O https://cdn.rstudio.com/r/centos-8/pkgs/R-${R_VERSION}-1-1.x86_64.rpm
      $ sudo yum install R-${R_VERSION}-1-1.x86_64.rpm
      

      验证 R 安装#

      通过运行测试 R 是否已成功安装:

      终端

      $ /opt/R/${R_VERSION}/bin/R --version
      

      C创建到 R 的符号链接#

      注意

      本部分仅适用于在给定系统上首次安装 R。对于后续安装,应跳过此部分。

      为确保 R 在默认系统 PATH 变量中可用,请创建指向您安装的 R 版本的符号链接:

      终端

      $ sudo ln -s /opt/R/${R_VERSION}/bin/R /usr/local/bin/R
      $ sudo ln -s /opt/R/${R_VERSION}/bin/Rscript /usr/local/bin/Rscript
      

      (可选)安装推荐的包#

      We recommend installing several optional system dependencies that are used by common R packages. Additional information about installing them is provided in our documentation.

      (可选)安装多个版本的 R#

      If you want to install multiple versions of R on the same server, you can repeat these steps to specify, download, and install a different version of R alongside existing versions.

      附加信息#

      Refer to the rstudio/r-builds repository on GitHub for more information on these binary distributions of R.

      Follow these steps to install R from source.

      请关注“恒诺新知”微信公众号,感谢“R语言“,”数据那些事儿“,”老俊俊的生信笔记“,”冷🈚️思“,“珞珈R”,“生信星球”的支持!

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