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      • R语言作图——Radar chart

      R语言作图——Radar chart

      • 发布者 一览
      • 分类 未分类
      • 日期 2020年3月2日
      • 评论 0评论

      分享下Radar chart的作图方法,其实雷达图我们在生活中能经常可以见到,比如大家很喜欢玩的王者荣耀里就有。通过简单的图形对比,人物特点一目了然。

      也经常用来评估学生的成绩和产品的性能。

      在生信领域,我们也可以用来比较评估样品的基因表达情况啦。

      作图数据如下:

      画出来的效果图如下:

      作图方法:
      <font size=4 color=red>Step1. 绘图数据的准备</font>
      首先还是要把你想要绘图的数据调整成R语言可以识别的格式excel中保存成csv格式。数据的格式就在上面啦。

      <font size=4 color=red>Step2. 绘图数据的读取</font>

      data<-read.csv(“your file path”, header = T)

      <font size=4 color=red>Step3.绘图所需package的安装、调用</font>

      install.packages("fmsb")
      library(fmsb)

      注:如果用恒诺新知的分析平台,则不再需要安装分析包,因为安装过程各种问题,我们的大神已经全部帮大家安装好。

      <font size=4 color=red>Step4.绘图数据格式调整</font>

      radarfig<-rbind(rep(15,10),rep(0,10),data)

      在原有的数据上增加了两行,

      第一、二行分别是每个纵轴的最大值、最小值,也可手动添加

      <font size=4 color=red>Step5.绘图</font>

      radarchart(radarfig, axistype=1,
                  pcol=rgb(69/255,137/255,137/255) , pfcol=rgb(69/255,137/255,137/255,0.6),    
                  plwd=4 ,seg=5,
                  cglcol="grey", cglty=1, cglwd=2,axislabcol="black" ,caxislabels=seq(0,15,3),
                  vlcex=0.7,calcex=0.7)

      如果从RStudio直接导出png或者jpeg格式的图片,还是会有之前小仙同学提过的“锯齿状”线条。之前的解决方案是导出eps格式,在Adobe Illustrator里打开再导出成需要的格式。但本小仙发现一个“巨坑”,就是RStudio导出的eps图形没有透明度,需要在AI里手动调整透明图。
      (其实R代码的这一部分本小仙很快就写好了 ,调整填充透明度费了老大劲,实名diss此bug)

      填充透明度调整方法如下:
      1.取消编组

      2.选中线条,对象—实时上色—建立

      3.选中线条,对象—拓展

      4.更改填充颜色,输入相应颜色RGB数值

      5.删掉图形白色背景

      6.外观—填色—不透明度—调整数值

      请关注“恒诺新知”微信公众号,感谢“R语言“,”数据那些事儿“,”老俊俊的生信笔记“,”冷🈚️思“,“珞珈R”,“生信星球”的支持!

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