R语言作图——Line plot
参考 https://www.jianshu.com/p/6c7fef530fe9
原来很常见的图标类型也可以“焕发新春”!

Step1. 绘图数据的准备
首先要把你想要绘图的数据调整成R语言可以识别的格式,建议大家在excel中保存成csv格式。
数据的格式如下图:一列表示一种变量,最后一列是每一行的行名。
假设我们有一组单细胞测序的基因表达量数据,第一至九列表示9种基因,第十列表示每一行细胞的标签。

Step2. 绘图数据的读取
data<-read.csv(“your file path”, header = T)
#注释:header=T表示数据中的第一行是列名,如果没有列名就用header=F
ave<-read.csv("your file path", header = T)
#注释:ave表示平均值数据
Step3.绘图所需package的安装、调用
library(ggplot2)
library(reshape2)
#注释:package使用之前需要调用
Step4.绘图
data_melt<-melt (data, id.vars="Cell")
ave_melt<-melt (ave, id.vars = "Type")
#注释:melt()函数把表格中的宽数据变成长数据,注意id.vars对应的参数是相应标签列的列名
p<-ggplot()+geom_line(data=data_melt,aes(x=variable,y=value,group=Cell),size=1,colour="gray")+
geom_line(data=ave_melt, aes(x=variable,y=value,group=Type),size=2,colour="#E3191C")+
theme(panel.background = element_blank(),axis.line = element_line(colour = "black"),
panel.border = element_rect(colour ="black",fill=NA))
p

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