R语言作图——Facet violin plot
Step1. 绘图数据的准备
老样子,准备好要作图的csv文件。
数据的格式如下图:列表示一种变量(特征),第一行是列名
a1~a9表示9种基因,TypeA~TypeC表示三种不同的细胞

Step2. 绘图数据的读取
data<-read.csv(“your file path”, header = T)
#注释:header=T表示数据中的第一行是列名,如果没有列名就用header=F
Step3.绘图所需package的安装、调用
#注释:大家要注意今天要用的package安装比较特别哟
install.packages("devtools")
library(devtools)
install_github("kassambara/easyGgplot2")
library(easyGgplot2)
#注释:今天还要用到一个新的函数,reshape2里的melt函数,可以把宽数据变成长数据
install.package("reshape2")
library(reshape2)
df<-melt(data,id.vars = c("type"))
Step4. 绘图<font>
ggplot2.violinplot(data=df,xName='variable',yName='value', #注释:xName表示x轴变量,yName表示y轴变量
groupName='variable', legendPosition="top",
faceting=TRUE,facetingVarNames="type")

<font color=”red”>Step5.美化</font>
ggplot2.violinplot(data=df,xName='variable',yName='value',
groupName='variable', legendPosition="top",
backgroundColor="white",
removePanelGrid=TRUE,
axisLine=c(0.5, "solid", "black"),
faceting=TRUE, facetingVarNames="type")


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