R语言作图——Facet violin plot

Step1. 绘图数据的准备
老样子，准备好要作图的csv文件。
数据的格式如下图：列表示一种变量(特征)，第一行是列名
a1~a9表示9种基因，TypeA~TypeC表示三种不同的细胞

Step2. 绘图数据的读取

data<-read.csv(“your file path”, header = T)  
#注释：header=T表示数据中的第一行是列名，如果没有列名就用header=F

Step3.绘图所需package的安装、调用

#注释：大家要注意今天要用的package安装比较特别哟
install.packages("devtools")       
library(devtools) 
install_github("kassambara/easyGgplot2")
library(easyGgplot2)

#注释：今天还要用到一个新的函数，reshape2里的melt函数，可以把宽数据变成长数据 
install.package("reshape2")  
library(reshape2)
df<-melt(data,id.vars = c("type"))

Step4. 绘图<font>

ggplot2.violinplot(data=df,xName='variable',yName='value',         #注释：xName表示x轴变量，yName表示y轴变量
                   groupName='variable', legendPosition="top",
                   faceting=TRUE,facetingVarNames="type")

<font color=”red”>Step5.美化</font>

ggplot2.violinplot(data=df,xName='variable',yName='value',
                   groupName='variable', legendPosition="top",
                   backgroundColor="white",
                   removePanelGrid=TRUE,
                   axisLine=c(0.5, "solid", "black"),
                   faceting=TRUE, facetingVarNames="type")