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      • R语言作图——Density plot

      R语言作图——Density plot

      • 发布者 一览
      • 分类 未分类
      • 日期 2020年3月2日
      • 评论 0评论

      参考: https://www.jianshu.com/p/492d7543c94f

      Step1. 绘图数据的准备
      首先还是要把你想要绘图的数据调整成R语言可以识别的格式,把excel保存成csv格式。
      数据的格式如下图:一列表示一种变量,第一行是列名

      Step2. 绘图数据的读取

      data<-read.csv(“your file path”, header = T)  #注释:header=T表示数据中的第一行是列名,如果没有列名就用 header=F

      Step3.绘图所需package的安装、调用

       install.package(“ggplot2”)                   #注释:ggplot2是目前公认绘图很强的一个安装包,如果已经安装,这句就不需要啦
       library(ggplot2)#注释:package使用之前需要调用(每次用前都要调用哦)

      Step4.绘图

       p<-ggplot(data, aes(x = weight))  #注释:x轴表示weight,y轴表示频率就不需要指定啦
       p + geom_density(color = "black", fill = "gray")      #注释:color是线条的颜色参数,fill表示填充颜色

      Step5.美化

      p + geom_density(aes(color = sex)) #注释:按照性别不同组改变线条颜色
      p + geom_density(aes(fill = sex), alpha=0.4) #注释:按照性别不同组改变填充颜色,alpha表示调整透明度

      到这里你已经可以画出比较高B格的density plot了,不过有些同学可能有
      特殊的要求,比如把两组的平均值画出来

      1.准备平均值数据并读取

      mean<-read.csv(“your file path”)

      2.画图

      p+ geom_density(aes(color = sex), alpha=0.4)+geom_vline(data = mean, aes(xintercept = mean, color=sex),linetype="dashed")  #注释:前面是和之前一样作图语句,在后面直接加上这一句就好啦,xintercept表示x轴截断线,dashed表示是虚线 

      请关注“恒诺新知”微信公众号,感谢“R语言“,”数据那些事儿“,”老俊俊的生信笔记“,”冷🈚️思“,“珞珈R”,“生信星球”的支持!

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