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目前核基因组突变和癌症之间的关联已被深入研究,但有证据表明线粒体基因组的一些突变也会促进癌症的发展。这篇文章研究的正是早期肺腺癌(LUAD)的线粒体基因组突变,以及它们对预后的影响。
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CTC / CTM已被证明是癌症诊断中的一种有前途的方法,其应用范围从肿瘤早期检测到治疗选择。与其他肿瘤成分(例如循环肿瘤DNA(ctDNA))相比,CTC / CTM为生信分析研究人员提供了完整的基因组和转录组信息来源。尽管已经发布了许多单细胞RNA测序数据,但研究人员很难使用这些数据,并且没有可访问的数据库。ctcRbase是第一个用于搜索和可视化CTC / CTM及其原发肿瘤,WBC和转移部位的表达模式的数据库。为研究人员了解肿瘤转移中的基因表达模式提供了更好的方法。网站目前的功能还少,ctcRbase未来还会不断更新并提供更多信息,包括:(i)更多的CTC / CTM转录组数据;(ii)CTC / CTM及其配对的原发肿瘤的DNA甲基化数据;(iii)更全面的CTC / CTM基因组数据,包括拷贝数变异数据和突变变异数据。
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