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在研究m6A时，m6A RNA免疫沉淀测序（m6A-RIP-seq）是最常用的m6A测序方法，但其分辨率较差（~150nt）。单碱基分辨率的m6A测序技术已经被开发，但之前技术主要利用交联和免疫沉淀m6A特异性抗体，进行反转录并在m6A位点诱导截断或突变。涉及的过程较繁琐，如放射性凝胶电泳。此外，没有对照以纠正抗体免疫沉淀的效率或标准化。为克服之前方法的技术局限性，新的m6A测序方法已被开发。
在170多种已知的RNA修饰中，N6-methyladenosine（m6A）是最丰富的mRNA修饰，其调节多种转录后过程，如mRNA降解、mRNA翻译、pre-mRNA剪切和pri-miRNA加工等。另一个突出的RNA修饰是N6,2′-O-dimethyladenosine（m6Am），其位于mRNA的第一个核苷酸处，与mRNA 帽相邻的2’-O-甲基腺苷的碱基甲基化形成（图1），m6Am能够抵抗DCP2介导的mRNA降解以稳定mRNA。
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