1.数据库database什么鬼？

官方解释：生物数据库是被组织起来的大量生物数据，这些数据通过计算机可被方便的访问、管理及更新。
花花的解释：生信专用的谷歌啊~

2.数据库肿么分类？

两种方法：
1.一级数据库、二级数据库
2.核酸数据库、蛋白质数据库、专用数据库

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3.业界有哪些牛X的数据库？

本文仅做出大纲，挑干的讲，具体用法及解析日后分解。

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3.1 文献数据库Pubmed

　　pubmed是一个生物医学文献数据库，坐拥生命科学领域文献、学术杂志以及在线专业书籍，大多数提供下载链接。
　　当然啦，想随便查点中文文献的话，中国知网、万方数据、百度学术都能搞定。如果想高大上一点，Google scholar、pubmed了解一下啊？不要问我Google scholar为什么打不开，我拒绝回答。

3.2 核酸数据库

3.2.1一级核酸数据库

主要包括三大核酸数据库和基因组数据库。
（1）三大核酸数据库
包括NCBI 的Genbank，EMBL 的ENA 和NIJ的DDBJ，它们共同构成国际核酸序列数据库合作联盟INSDC。
（花花注解：用Genebank就行，因为这仨数据库里面的数据基本是一样的，NCBI网站里就有genebank的链接。）
（2）基因组数据库Ensemble
（3）微生物宏基因组数据库JCVI

附注（瞅瞅这些大牛数据库是那些机构搞的）：
genebank:美国国家生物技术信息中心NCBI，NCBI 隶属于美国国立卫生研究院NIH。
ENA:欧洲分子生物学研究室EMBL
DDBJ:日本国立遗传学研究所NIG
Ensemble：欧洲生物信息学研究所EBI 和英国桑格研究院
JCVI 克莱格反特研究所(与数据库同名)

3.2.2 二级核酸数据库

RefSeq https://www.ncbi.nlm.nih.gov/refseq/
dbEST https://www.ncbi.nlm.nih.gov/dbEST/
Gene https://www.ncbi.nlm.nih.gov/gene
ncRNA http://biobases.ibch.poznan.pl/ncRNA
microRNA http://www.mirbase.org/
RefSeq 数据库，也叫参考序列数据库，是通过自动及人工精选出的非冗余数据库，包括基因组序列、转录序列和蛋白质序列。
dbEST 数据库，也就是表达序列标签数据库，存储的是不同物种的表达序列标签。
Gene 数据库以基因为记录对象为用户提供基因序列注释和检索服务，收录了来自5300 多个物种的430 万条基因记录。
ncRNA（非编码RNA 数据库）提供非编码RNA 的序列和功能信息。
microRNA 数据库主要存放已发表的microRNA 序列和注释。可以分microRNA 在基因组中的定位和挖掘microRNA 序列间的关系。

3.3蛋白质数据库

3.3.1.蛋白质一级数据库

（1）序列数据库：UniProt

　　包含三大蛋白质序列数据库，Swiss-Prot，TrEMBL 和PIR，分为三个层次：
　　第一层是UniParc，收录了所有UniProt 数据库子库中的蛋白质序列，量大，粗糙。第二层是UniRef，他归纳了UniProt 几个主要数据库并且是将重复序列去除后的数据库。第三层是UniProtKB，他有详细注释并与其他数据库有链接，分为Swiss-Prot（最有用的）和TrEMBL。

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