零基础如何快速入门生信分析并且告别调包侠成长攻略
专题介绍:数据分析那些事儿是瑞典农业科学大学的一名科研工作者。在生物大数据分析领域已经有七年的科研经验。希望通过分享过去7年在国内外硕士、博士、博士后申请、求学、科研、求职、统计学、R&Python编程、生物大数据分析、国内外高校企业求职 生命科学发展对我们当下社会的影响 中收到的个人启发 来让1000个人受益 让求学求职生活变得容易一点点。如果你也想持续学习,克服懒惰的话。关注他参与“100天生信/数据科学自我挑战”的话题吧。
大家好,开始和大家聊数量多组学分析已经有24个视频了,今天和大家聊聊如何利用这些视频零基础快速入门生信且告别调包侠,成为一个合格的从业人员。
不知道大家有没有好奇我们为什么花时间讲了前面这些内容,这些内容在我们学习生信有什么作用,这些视频如何串联起来构建一个学科体系。
1-2期视频主要介绍了课程的背景、以及过去百年学科的发展和未来的一些应用场景。这三期视频能够帮助大家了解,什么是数量多组学课程,它究竟对我们求学科研也好或者说医药和农业领域的工作,大概有什么用。
3-4期视频主要介绍了一些生物学基础,帮助跨学科的同学(非生物)了解,我们数量多组学(乃至生信)大概在解决一个什么问题。
5-15期视频,我们主要介绍了一二三代测序原理与分子标记检出,主要目的是帮助大家了解测序技术原理,掌握分子标记检出的常用方法,帮助大家在未来科研和工作分析测序数据奠定基础。
16-19期视频,我们主要介绍了表观组学的原理和如何通过测序技术拿到表关水平的变异,帮助大家在未来科研和工作中解读表关变异奠定基础
20-24期,我们主要是面向实战,介绍了一些Linux系统的基础知识,我们这些介绍都非常浅显,目的是帮助大家抓住日常分析中主要知识,快速的能在Linux环境下上手分析自己的数据。
接下来的几期视频,我们会沿着在序言(第一期视频之前我们有个课程概括)提到的内容,从生物信息学分析实战(变异检出、RNA seq)、统计学与R基础聊起,为大家奠定一定技术基础,从而能够理解我们后面提到的QTL GWAS 以及更加复杂的多组学分析。
之所以这么设计视频的内容和顺序,是因为生信是个相对来说比较交叉的学科,设计Linux和编程基础知识、生物学基础知识、NGS相关知识和统计学等,如果没有这些基础,很容易沦为只会跑流程、换个科学问题就懵逼的调包侠。所以希望能自己动手针对具体科学问题搭建流程,针对不同问题提出个性化解决方案的同学请务必认真思考把每个视频的内容能够串起来,搭建自己的学科体系。
今天就和大家聊到这里,下次我们聊聊Variant calling、RNA-seq等生信中比较基础的几个实战内容。
关于作者
你好,我是山石,山西农业大学(本)、天津大学(硕)、瑞典乌普萨拉大学(博),瑞典农业科学大学(博士后)。
在生命科学领域学习工作了15年,目前为瑞典农业大学生物大数据研究员。从普通二本院校到世界百强大学,一路踉跄走到了求学路的尽头。虽未获得成功,但是心中的小火苗还没有熄灭。此刻,怀着内心中剩下的执着和追求,开启了职场终身学习征程。
我同时是知乎、公众号和bilibili博主:数据科学那些事,日常分享生命科学领域升学、科研和工作必备成长技能与经验,欢迎围观。
对抗行业内卷最好的方式,就是在相互交流中不断学习,相互鼓励,共同进步。因此诚挚的邀请志同道合的前辈、同行和后浪,加入<<数据科学技术经验交流群 >>、<<国内外生命科学领域博士申请交流群 >>,<<国内外生命科学领域教职、工作申请交流群 >>,请私信VX(15934076136)。
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