生信小白第9天-质控小故事
测试开头
测试结尾
今天是生信星球陪你的第9天
你想找辆共享单车,发现满街都是别家车,没有一辆你能骑。
你想学点生信,搜了“初学者教程”,满眼尽是高大上,没有一句能看懂。
终于你跨越茫茫宇宙,来到生信星球,发现了初学者的新大陆!
豆豆今天上来想先提问一个问题:有没有因为着急拿到结果而拿到数据直接跑流程,将数据本身的意义抛之脑后?
豆豆第一次独立完成的是一个师姐的转录组项目,主要就是检测各个基因在不同样本中的表达量。拿到公司测序数据后,豆豆就开始摩拳擦掌,将之前准备好的软件和脚本拿出来,直接进行了 fastqc,然后并没有分析其中的数据意义,然后进行了trimmomatic过滤,参数也是基本使用的默认参数,自己没有进行调整。
然后…运行着运行着,就发现许多基因的表达量数据不对,或者缺少了许多应该存在的基因表达量数据。检查多遍发现,原来是因为一开始过滤的参数设置不合理,再一想,是因为没有对质控结果进行认真的分析~
所以,一开始我们如果能懂一些基础知识,掌握qc(质控)的原理,那么就能防患于未然,磨刀不误砍柴工。
明天520,今天在海陵岛度假⛱️,碰巧么有wifi,用流量支撑着,不过每日推送还是要做的。
好啦,祝大家节日快乐,晚安啦!明天记得给亲人爱人一份真挚的祝福哦
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