生信小白必踩的坑之安装软件

今天是生信星球陪你的第32天

   你想找辆共享单车，发现满街都是别家车，没有一辆你能骑。

   你想学点生信，搜了“初学者教程”，满眼尽是高大上，没有一句能看懂。

   终于你跨越茫茫宇宙，来到生信星球，发现了初学者的新大陆！

  继上次研究了sam和bam谁是谁之后，花花开始下载恐怖的常用的基本的生信软件samtools。

花花的碎碎念：啊，不就是个源代码包吗，上次都说了，下载，解压，完了改configure里的prefix，就make，makefile好啦？？？

直到出现了一个奇葩的报错，花花搞了半下午。

👇报错长这副怂样：

谁跟谁？

百度一下fprintf，c语言里的某个巴啦啦。谢谢，不会。

搜不到答案，开始求助。转了一圈也没搞明白，被整的云里雾里，直到豆豆想起来，好像samtools里有一个hts？就在这时花花也得到了大牛给的代码，发现了htslib的痕迹~

豆豆无意间发现，忽略报错，直接make install，再定睛一看，绿色的可执行文件已经出现了…

好吧，再进到samtools下的htslib文件夹，同样修改configure的prefix为环境变量，make，make install就可以了。

看明白了吗？一个坑中坑。samtools压缩包里自带了htslib，只是没告诉你需要自己编译

跳过了这个坑，应该可以妥妥的安其他软件了吧~

关于configure /make /make install看不明白的跳回源代码包和二进制包的碎碎念研究一下吧~~

字虽然少，都是干货

–花花

       初学生信，很荣幸带你迈出第一步。

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