• 主页
  • 课程

    关于课程

    • 课程归档
    • 成为一名讲师
    • 讲师信息
    同等学历教学

    同等学历教学

    免费
    阅读更多
  • 特色
    • 展示
    • 关于我们
    • 问答
  • 事件
  • 个性化
  • 博客
  • 联系
  • 站点资源
    有任何问题吗?
    (00) 123 456 789
    weinfoadmin@weinformatics.cn
    注册登录
    恒诺新知
    • 主页
    • 课程

      关于课程

      • 课程归档
      • 成为一名讲师
      • 讲师信息
      同等学历教学

      同等学历教学

      免费
      阅读更多
    • 特色
      • 展示
      • 关于我们
      • 问答
    • 事件
    • 个性化
    • 博客
    • 联系
    • 站点资源

      老俊俊的生信笔记

      • 首页
      • 博客
      • 老俊俊的生信笔记
      • shiny-server内网穿透

      shiny-server内网穿透

      • 发布者 weinfoadmin
      • 分类 老俊俊的生信笔记
      • 日期 2021年9月10日
      • 评论 0评论

      感谢老俊俊的大力支持。我们会每日跟新,欢迎您关注老俊俊的生信笔记。

      写好的shiny App怎么分享?

      • 通过源代码分享上传githup
      • 发布在shiny官网上shinyapps.io
      • 制作成 Desktop exe等软件形式
      • 部署在服务器上shiny-server

      1、源代码分享和上传到githup是比较方便的,但是使用的话得下载自己运行,还需要用户拥有R软件才行。
      2、发布在shiny官网上方便,随时都可以使用,但是就是国外网址进入比较慢,而且过一段时间不用容易disconect,必须reload或刷新才行,此外还有数量限制,5个免费APP,我 “第二期文章” 讲过。

      制作成可分发的应用会比较麻烦,比较容易报错,可参考这两篇文章:

      • 将Shiny APP搭建为独立的桌面可执行程序
      • 如何将Shiny打包成独立的客户端应用程序

      在服务器上运行一个app

      # app文件夹放在、/srv/shiny-server/目录下
      (base) root@DESKTOP-NH8LU7H:/srv/shiny-server# ls -l
      drwxr-xr-x 3 root root 4096 Jun  2 13:46 CountToTPM-FPKM
      drwxr-xr-x 2 root root 4096 Apr 26 22:30 hello
      -rw------- 1 root root  428 Jun  2 16:32 nohup.out

      查看自己的ip地址:  <172.24.107.255>

      (base) root@DESKTOP-NH8LU7H:/srv/shiny-server# ifconfig
      eth0: flags=4163<UP,BROADCAST,RUNNING,MULTICAST>  mtu 1500
              inet 172.24.107.255  netmask 255.255.240.0  broadcast 172.24.111.255
              inet6 fe80::215:5dff:fe17:273c  prefixlen 64  scopeid 0x20<link>
              ether 00:15:5d:17:27:3c  txqueuelen 1000  (Ethernet)
              RX packets 587974  bytes 723570787 (723.5 MB)
              RX errors 0  dropped 0  overruns 0  frame 0
              TX packets 252269  bytes 21888743 (21.8 MB)
              TX errors 0  dropped 0 overruns 0  carrier 0  collisions 0

      lo: flags=73<UP,LOOPBACK,RUNNING>  mtu 65536
              inet 127.0.0.1  netmask 255.0.0.0
              inet6 ::1  prefixlen 128  scopeid 0x10<host>
              loop  txqueuelen 1000  (Local Loopback)
              RX packets 3339  bytes 5390676 (5.3 MB)
              RX errors 0  dropped 0  overruns 0  frame 0
              TX packets 3339  bytes 5390676 (5.3 MB)
              TX errors 0  dropped 0 overruns 0  carrier 0  collisions 0

      启动shiny-server服务,挂在后台

      (base) root@DESKTOP-NH8LU7H:/srv/shiny-server# nuohup shiny-server &
      • 在浏览器输入ip:3838/app文件夹名称即可运行app
      • http://172.24.107.255:3838/CountToTPM-FPKM/
      • 这样就在本地网页上运行了我们的app
      • 如果运行不了,去/var/log/shiny-server/目录下寻找报错的log文件,一般是没有安装app内需要的R包,在终端进入R安装一下就行了

      内网穿透通过外网访问

      • 本地网页上运行的app别人是访问不了也无法使用的,那么我们可以使用一些工具能够达到外网也能进入的效果

      by the way,插播一波广告,B站上生信技能树有 shiny的免费教学视频,shiny基础到shiny的部署等,同时也感谢生信技能树的分享和传播。

      开始操作:

      • 下载utools,注册并登录

      • 进入utools下载安装内网穿透插件,打开插件

      • 按下图填入我们的网址


      • 外网域名的名字随意填
      • 内网地址填入我们本地ip地址
      • 内网端口3838
      • 填好以后点击连接,连接成功以后复制地址,上下两个均可
      • 最后在我们的浏览器输入
        复制的网址/CountToTPM-FPKM/
      • https://zhoulab.cn.utools.club/CountToTPM-FPKM/

      这样任何人都可以通过这个网址使用你的app了,不会像shinyapps.io官网这么慢了。

      今天的分享就到这里了,敬请期待下一篇!

      最后欢迎大家分享转发,您的点赞是对我的鼓励和肯定!

      如果觉得对您帮助很大,打赏一下吧!


      请关注“恒诺新知”微信公众号,感谢“R语言“,”数据那些事儿“,”老俊俊的生信笔记“,”冷🈚️思“,“珞珈R”,“生信星球”的支持!

      • 分享:
      作者头像
      weinfoadmin

      上一篇文章

      怎么把 shiny App 做成 exe 文件进行分发
      2021年9月10日

      下一篇文章

      用shiny创作在线火山图绘制App
      2021年9月10日

      你可能也喜欢

      8-1651542331
      跟着Nature学绘图(2) 箱线图-累积分布曲线图
      2 5月, 2022
      9-1651542322
      Julia 笔记之字符串
      2 5月, 2022
      0-1651542343
      Julia 笔记之数学运算和初等函数
      1 5月, 2022

      留言 取消回复

      要发表评论,您必须先登录。

      搜索

      分类

      • R语言
      • TCGA数据挖掘
      • 单细胞RNA-seq测序
      • 在线会议直播预告与回放
      • 数据分析那些事儿分类
      • 未分类
      • 生信星球
      • 老俊俊的生信笔记

      投稿培训

      免费

      alphafold2培训

      免费

      群晖配置培训

      免费

      最新博文

      Nature | 单细胞技术揭示衰老细胞与肌肉再生
      301月2023
      lncRNA和miRNA生信分析系列讲座免费视频课和课件资源包,干货满满
      301月2023
      如何快速批量修改 Git 提交记录中的用户信息
      261月2023
      logo-eduma-the-best-lms-wordpress-theme

      (00) 123 456 789

      weinfoadmin@weinformatics.cn

      恒诺新知

      • 关于我们
      • 博客
      • 联系
      • 成为一名讲师

      链接

      • 课程
      • 事件
      • 展示
      • 问答

      支持

      • 文档
      • 论坛
      • 语言包
      • 发行状态

      推荐

      • iHub汉语代码托管
      • iLAB耗材管理
      • WooCommerce
      • 丁香园论坛

      weinformatics 即 恒诺新知。ICP备案号:粤ICP备19129767号

      • 关于我们
      • 博客
      • 联系
      • 成为一名讲师

      要成为一名讲师吗?

      加入数以千计的演讲者获得100%课时费!

      现在开始

      用你的站点账户登录

      忘记密码?

      还不是会员? 现在注册

      注册新帐户

      已经拥有注册账户? 现在登录

      close
      会员购买 你还没有登录,请先登录
      • ¥99 VIP-1个月
      • ¥199 VIP-半年
      • ¥299 VIP-1年
      在线支付 激活码

      立即支付
      支付宝
      微信支付
      请使用 支付宝 或 微信 扫码支付
      登录
      注册|忘记密码?