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      你有一份作业未领取

      • 发布者 weinfoadmin
      • 分类 未分类, 老俊俊的生信笔记
      • 日期 2021年9月10日
      • 评论 0评论

      感谢老俊俊的大力支持。我们会每日跟新,欢迎您关注老俊俊的生信笔记。


      点击上方内容,关于我们



      快要开学了呢


      文献里看到的一个小图:

      于是发在 生信星球 里当成一个小作业,结合我之前写的 igraph 和 ggraph 文章,给小伙伴们投稿。自己有空了顺便写了一下,结果就自己投我自己的稿了,哈哈哈。

      下面是代码:



      构建数据:

      # 加载R包
      library(igraph)

      # 构建数据
      da <- data.frame(from = c('Neuronal'),
                       to = c('Muscle','Gut','Parenchymal','Secretory','Neoblast','Epidermal'))

      da

            from          to
      1 Neuronal      Muscle
      2 Neuronal         Gut
      3 Neuronal Parenchymal
      4 Neuronal   Secretory
      5 Neuronal    Neoblast
      6 Neuronal   Epidermal



      绘图:

      # 绘图

      # 转换为graph对象
      g <- graph_from_data_frame(da,directed = T)

      # 节点颜色
      col = c('#986D8E','#C1AC95','#64C9CF','#CD0A0A','#61B15A','#BA135D','violetred1')

      # 绘图
      plot(g,
           main = expression(italic('MTNR1B')), # 标题斜体
           layout = layout.star, # 星形布局
           vertex.size = 32, # 节点大小
           vertex.frame.color = 'black', # 节点边框颜色
           edge.color = 'black', # 边颜色
           edge.width = '2', # 变粗细
           edge.arrow.size = 1, # 箭头大小
           edge.arrow.width = 1.2, # 箭头宽度
           edge.arrow.mode = 2, # 箭头样式
           vertex.label.cex = 1, # 节点标签大小
           vertex.label.color = 'black', # 节点标签颜色
           vertex.color = col, # 节点颜色
           vertex.frame.color = 'black', # 节点边框颜色
           vertex.label.degree = c(1.5,1.5,1.5,1.5,1.5,1.5,1.5), # 节点标签对齐
           vertex.label.dist = c(-4,-4,-4,-4,-4,4,4), # 节点标签离节点距离
      )

      关键点 1:

      这里颜色的顺序和节点的顺序是这样的:

      关键点 2:

      按照顺序给定颜色就行了,还有文字的位置调整结合 vertex.label.degree 和 vertex.label.dist 慢慢调就好了。

      关键点 3:

      使用 expression(italic('字符串')) 来给字符串变成斜体。


      收官!


      代码 我上传到 QQ 群 老俊俊生信交流群 文件夹里。欢迎加入。加我微信我也拉你进 微信群聊 老俊俊生信交流群 哦。

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