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      老俊俊的生信笔记

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      • 掌握生信技术,玩转植物与土壤微生态领域的科研套路

      掌握生信技术,玩转植物与土壤微生态领域的科研套路

      • 发布者 weinfoadmin
      • 分类 老俊俊的生信笔记
      • 日期 2021年11月7日
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      掌握生信技术,玩转植物与土壤微生态领域的科研套路



      宏基因组/微生物组是当今世界科研最热门的研究领域之一,中科院科研人员创立“宏基因组”公众号,入选科研圈评选“2019年度学术媒体优质公众号”,联合海内外同行共同打造本领域纯干货技术及思想交流平台。工作日分享最新成果、科研思路、实验和分析技术、R语言统计绘图,理论过硬实战强;周末科普和生活专栏,轻松读文看片涨姿势。目前分享2800+篇原创文章,12万+同行在这里一起交流学习,欢迎投稿,感兴趣的赶快关注吧!




      掌握生信技术,玩转植物与土壤微生态领域的科研套路

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      由中科院、中医科学院的科技人员创立的生物信息专业公众号,精心组织面向生信学习的Python、R可视化、Linux/Shell语言系列教程、生信工具精品教程、单细胞数据分析、TCGA/GEO数据分析,扩增子/宏基因组,批次校正/WGCNA/GSEA,机器学习等特色分析和心得体会。

      通过大量的生信例子、代码分享、原理阐释和录制视频帮助快速掌握生信知识。同时提供高颜值免费在线SCI绘图工具ImageGP和全功能Venn图工具EVenn为科研作图助力。

      目前有10万+海内外同行一起学习,千篇原创内容,总阅读千万次,赶快关注快速提高自己的生物信息分析技能吧!(后台回复“生信宝典福利”获取生信宝典原创系列教程合集)




      掌握生信技术,玩转植物与土壤微生态领域的科研套路

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      每天学习多一点,希望我们的推送对您的科研、工作与生活有所启发与帮助。
      这里有观点、有态度、有技巧,也该有你!掌握生信技术,玩转植物与土壤微生态领域的科研套路

      往期精彩,可见一斑 ↓↓↓


      Ecological Monographs | 从现代物种共存理论的视角看土壤微生物对植物竞争的影响

      Nature Communications丨养分导致土壤碳通量对小部分细菌群落的固结作用

      Ecology讲模型!| 生态学探索、推理和预测模型选择的实用指南

      全球68个科研单位86位科研人员合作搞事情:2020年全球碳收支

      ISME | 土壤微生物应对生态系统持续干旱的响应机制

      ISME | 侵蚀降低了土壤微生物多样性、网络复杂性和多功能性

      ISME | 光照调控水稻根际微生物群落昼夜节律

      Nature Communications丨周期性干旱的生态记忆通过土壤微生物群落的变化改变土壤过程

      植物入侵改变了群落结构,降低了丛枝菌根真菌群落的多样性




      掌握生信技术,玩转植物与土壤微生态领域的科研套路

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      《微生态》以助力科研为己任,专注于微生态系统的各种研究。秉承“掌握科研动向,共享知识平台”的理念,微生态定期开展微生态前沿领域公益讲座,汇总微生态相关研究进展,解读微生态研究论文,分享各类干货贴,还有免费的微生物工具书可以领取哦~主要采用的技术有菌群多样性测序,宏基因组测序,宏转录组测序,基因组测序,转录组测序,蛋白质组和代谢组相关技术,希望为您的微生态研究锦上添花。

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      科研 | 中科院生态环境中心:芦苇根际锰氧化物加速人工湿地氨氧化(国人佳作)



      掌握生信技术,玩转植物与土壤微生态领域的科研套路

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      作图丫团队成员主要由哈尔滨医科大学生信毕业的生信团队创建,该团队主要擅长公共数据库课题设计和数据挖掘、单细胞数据/芯片数据/ChIP-seq数据/DNA甲基化/转录组/WES/WGS等数据分析,对多数据平台整合以及课题设计均有丰富经验。


      “作图丫”主要关注作图、scRNA分析、生信实用技巧、肿瘤数据库使用教程以及肿瘤高分文献解读。希望以通熟易懂的作图代码、深入浅出的流程分析套路以及精准的、高水平的文章解读陪伴科研路上的小伙伴成长,同时也希望能够通过这个平台一起交流学习。

      团队创建经验交流群,加”zuotuya“好友后邀请进群,欢迎大家踊跃加入,互相交流,共同进步。




      掌握生信技术,玩转植物与土壤微生态领域的科研套路

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      主要分享以下相关内容


      “

      • 1、R 语言可视化(ggplot2)。
      • 2、RNA-seq、ChIP-seq、MeRIP-seq、Ribo-seq、circRNA-seq 等二代测序数据分析。
      • 3、R 语言编程。
      • 4、相关文献解读分享。
      • 5、shiny 可视化。
      • 6、R 包分享。

      ”




      掌握生信技术,玩转植物与土壤微生态领域的科研套路

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      有以下内容:

      这里有无所不能的图形可视化方案,不断创造出来的绘图技法,只需访问话题:科研绘图研究工作室;

      十分强大的组学学习平台,请访问:扩增子研究工作室;跟着science学习宏基因组,代谢组研究室,转录组研究室;

      这里有新的工具,原创工具开发专题:团队成果ggClusterNet;团队成果-EasyStat包专题;

      对于绘图,示意图极致的追求请查看专辑:科研示意图;

      另外这些专题你们大家就自由浏览啦:Origin绘图;效率科研;团队文章成果;团队关注;袁老师小小组;


      备注:EasyStat:学习基于R语言目前最为方便和强大的统计可视化方案。

      备注:ggClusaterNet: 基于R语言模拟Gephi

      和 Cytoscape网络可视化方案,并有网络分析的全套解决方案。



      掌握生信技术,玩转植物与土壤微生态领域的科研套路

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      关注土壤、植物微生态领域学习内容,分享有启发意义的领域最新前沿。主要内容包括:微生态学概念扩展、微生物群落构建、微生物组抗逆、宿主–环境–病原菌三角关系、种子相关微生物群落、数据分析与可视化等内容。

      测试结尾

      请关注“恒诺新知”微信公众号,感谢“R语言“,”数据那些事儿“,”老俊俊的生信笔记“,”冷🈚️思“,“珞珈R”,“生信星球”的支持!

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