荧光定量（qPCR）结果整理的辅助小工具

参考： https://www.jianshu.com/p/42ceb9dd21be

写在前面

荧光定量（qPCR）早已是各个分子生物学实验室常用的简单的实验技术。十年的变化很大。10年前（我大一）到实验室时，常规的pcr都不舍得加多0.2ul的rTaq，更不提跑一个qPCR就烧掉大几百的荧光定量。伴随着测序成本的降低和科研经费支持的增加（主要是说我们小打小闹的单位），qPCR实验天天都做，天天都要处理和分析数据。

写这个小工具的动机

针对qPCR数据的分析方法有两种，其中一种即为 2deltadelta….（具体请参考荧光定量PCR的随机手册）。虽然事实上，每台机器应该都会有随机软件可以用于分析，但可能多数人还是并不习惯或者喜欢使用该些软件。或许主要原因是….用起来太麻烦。
三四年前，我记得我一直有喊师弟或者师妹去写一个脚本或者软件，这样会简化分析流程，可以省下很多时间。但或许，没有做过定量PCR的师弟或者师妹，并不会了解到，整理结果数据，是一件繁杂和痛苦的事情。
近期，硕士课题组的师兄和师妹希望能有一个相对便捷的，整理qPCR结果的工具，恰好家里网络出了点问题，我便随手写了一个。

小工具的使用

输入数据

需要的输入数据，只有三列，用制表符分隔，用户可以用Excel整理成以下形式，并另存为文本文件，或者直接新建一个txt文件，并黏贴进去后保存。

数据说明：

1. 第一行是标题行，可以省略
2. 第一列是样本名称
3. 第二列是看家基因的Ct值（比如Actin的…）
4. 第三列是关注的基因的Ct值
5. 示例数据中，每个样本是三个重复，而实际上可以无限个重复
6. 重复可以不放在相邻的行

注意，第一个样本，将会作为Control，亦即，可以预计，其计算结果为1

使用工具

打开工具

拖拽或者通过摁钮选择，设置输入文件

设置一个输出文件路径

点击Start即可得到结果

结果解读

如上图，结果文件中：

1. 第一行为标题行
2. 第一列为样本信息
3. 第三列为相对表达量均值
4. 第四列为标准差

直接输出图片

顺手把可视化的也写上，毕竟用Excel加个误差棒还是有点麻烦。