多组别-多基因的mRNA表达量的计算与作图

上一篇推文推出后Realtime-PCR的包，有同学想同时计算多组别-多基因的计算与绘图，今天中午在实验室没有休息给大家推送定量qPCR的数据绘图。

用excel打开查看原始ct1_1.csv数据文件，如下图，1-3行为肝正常细胞样本（normal）；4-6行为肝癌细胞样本（HCC）；7-9行为 加药处理的HCC细胞样本（HCC_Drug）。ACTB为内参基因，其余12个为目的基因。

如何通过pcr包求得12个基因分别在HCC,HCC_Drug组中的相对表达量？

输出ct1_1数据如下：

输出Final_result结果如下：

如上图Final_result结果所示，与normal组相比，BIRC5**分别**在HCC组，HCC_Drug组的相对表达量为1.96，13.69倍。其它11个基因各自的表达量也一目了然。

现在提取Final_result的数据用来作柱状图

exprs输出结果如下：

最终展示各个基因在不同组的表达情况的柱状图如下：

ct1_1.csv数据我已经上传到百度云盘

链接:https://pan.baidu.com/s/13–f3YBQajo3ZNuA6l9PuQ 密码:l3eu