R读取excel文件的最佳方式
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测试结尾
今天是生信星球陪你的第859天
大神一句话，菜鸟跑半年。我不是大神，但我可以缩短你走弯路的半年~
就像歌儿唱的那样，如果你不知道该往哪儿走，就留在这学点生信好不好~
这里有豆豆和花花的学习历程，从新手到进阶，生信路上有你有我!
背景
众所周知，excel生成的文件后缀是xls或者xlsx，早期读取这样的文件，要么就另存为csv格式，要么就用readxls或者xlsx这样的R包，可能会遇到Rjava报错的问题。现在有了一个优秀的解决办法，就是rio包。
它能够兼容含有多个工作簿的xlsx文件，非常巴适。
1.编数据
用R语言的内置数据组个列表。
l = list(iris = head(iris),
ToothGrowth = head(ToothGrowth))
l
## $iris
## Sepal.Length Sepal.Width Petal.Length Petal.Width
## 1 5.1 3.5 1.4 0.2
## 2 4.9 3.0 1.4 0.2
## 3 4.7 3.2 1.3 0.2
## 4 4.6 3.1 1.5 0.2
## 5 5.0 3.6 1.4 0.2
## 6 5.4 3.9 1.7 0.4
## Species
## 1 setosa
## 2 setosa
## 3 setosa
## 4 setosa
## 5 setosa
## 6 setosa
##
## $ToothGrowth
## len supp dose
## 1 4.2 VC 0.5
## 2 11.5 VC 0.5
## 3 7.3 VC 0.5
## 4 5.8 VC 0.5
## 5 6.4 VC 0.5
## 6 10.0 VC 0.5
2.将包含多个数据框的列表导出为xlsx
它就变成了含有多个工作簿的电子表格哦。
library(rio)
export(l,file = "test.xlsx",overwrite = T)
3.将含有多个工作簿的电子表格读入到R语言
有import函数可以读取各种类型的文件，但对于xlsx它只识别第一个工作簿。用import_list读取即可
l2 = import("test.xlsx")
l2
## Sepal.Length Sepal.Width Petal.Length Petal.Width
## 1 5.1 3.5 1.4 0.2
## 2 4.9 3.0 1.4 0.2
## 3 4.7 3.2 1.3 0.2
## 4 4.6 3.1 1.5 0.2
## 5 5.0 3.6 1.4 0.2
## 6 5.4 3.9 1.7 0.4
## Species
## 1 setosa
## 2 setosa
## 3 setosa
## 4 setosa
## 5 setosa
## 6 setosa
l3 = import_list("test.xlsx")
l3
## $iris
## Sepal.Length Sepal.Width Petal.Length Petal.Width
## 1 5.1 3.5 1.4 0.2
## 2 4.9 3.0 1.4 0.2
## 3 4.7 3.2 1.3 0.2
## 4 4.6 3.1 1.5 0.2
## 5 5.0 3.6 1.4 0.2
## 6 5.4 3.9 1.7 0.4
## Species
## 1 setosa
## 2 setosa
## 3 setosa
## 4 setosa
## 5 setosa
## 6 setosa
##
## $ToothGrowth
## len supp dose
## 1 4.2 VC 0.5
## 2 11.5 VC 0.5
## 3 7.3 VC 0.5
## 4 5.8 VC 0.5
## 5 6.4 VC 0.5
## 6 10.0 VC 0.5
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