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      • 精致小 R 包: lemon

      精致小 R 包: lemon

      • 发布者 weinfoadmin
      • 分类 老俊俊的生信笔记
      • 日期 2022年1月2日
      测试开头


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      精致小 R 包: lemon

      1引言

      最近一段时间一直在更新 python 的教程和推文,推文阅读量也是屈指可数,今天分享个 R 包 lemon, 让公众号的温度回回火,太难了,哈哈哈。

      精致小 R 包: lemon

      也是 ggplot 的一个拓展包,功能包括上面图片里的,轴,分面,点线,图例 等小功能。还是很实用的。

      2安装

      # install.packages("devtools")

      # Install release from GitHub:
      devtools::install_github("stefanedwards/lemon", ref='v0.3.1')

      # Or get the lastest development version from GitHub:
      devtools::install_github("stefanedwards/lemon")

      3限制轴线范围

      library(lemon)
      library(patchwork)
      library(ggplot2)

      p1 <- ggplot(mtcars, aes(x=cyl, y=mpg)) +
        geom_point() +
        theme_light() +
        theme(panel.border=element_blank(),
              axis.line = element_line())

      # limit axis
      p2 <- p1 +
        coord_capped_cart(bottom='both', left='none')

      p1 + p2
      精致小 R 包: lemon

      分类变量:

      # x轴分类
      p <- ggplot(mtcars, aes(x=as.factor(cyl), y=mpg)) +
        geom_point(position=position_jitter(width=0.1)) +
        theme_light() +
        theme(panel.border=element_blank(),
              axis.line = element_line()) +
        coord_flex_cart(bottom=brackets_horisontal(),
                        left=capped_vertical('both'))

      p
      精致小 R 包: lemon

      4分面

      # 分面
      p + facet_rep_wrap(~gear, ncol=2, label=label_both)
      精致小 R 包: lemon

      5点线图层

      作者就给了个图:

      精致小 R 包: lemon

      6图例

      # 图例位置
      dsamp <- diamonds[sample(nrow(diamonds), 1000), ]

      d <- ggplot(dsamp, aes(carat, price)) +
        geom_point(aes(colour = clarity))

      reposition_legend(d, 'top left')
      精致小 R 包: lemon

      绘制图例:

      library(grid)
      legend <- g_legend(d)
      grid.newpage()
      grid.draw(legend)
      精致小 R 包: lemon

      合并图例:

      # combine legend
      dsamp <- diamonds[sample(nrow(diamonds), 1000), ]

      p1 <- qplot(carat, price, data = dsamp, colour = clarity)
      p2 <- qplot(cut, price, data = dsamp, colour = clarity)
      p3 <- qplot(color, price, data = dsamp, colour = clarity)
      p4 <- qplot(depth, price, data = dsamp, colour = clarity)

      grid_arrange_shared_legend(p1, p2, p3, p4, ncol = 2, nrow = 2)
      精致小 R 包: lemon
      精致小 R 包: lemon


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      测试结尾

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