听说你不想把R包安装在C盘–修改R包默认安装路径

测试开头

【历史文章】那天是生信星球陪你的第353天

大神一句话，菜鸟跑半年。我不是大神，但我可以缩短你走弯路的半年~

就像歌儿唱的那样，如果你不知道该往哪儿走，就留在这学点生信好不好~

这里有豆豆和花花的学习历程，从新手到进阶，生信路上有你有我！

曾以为.libPaths()是个类似于getwd()的函数，只能看看，今天才发现其实它也可以设置。是查看和设置R包安装路径用的。
先查看一下安装路径

.libPaths()
#[1] "C:/Users/kingjie/Documents/R/win-library/3.5"
#[2] "C:/Program Files/R/R-3.5.2/library"

都是在C盘，有两种方法可以修改

方法一：

先声明，这个方法是一次性的。在D盘新建一个文件夹叫rpackage

.libPaths(c(.libPaths(),"D:/rpackage"))
.libPaths()
#[1] "C:/Users/kingjie/Documents/R/win-library/3.5"
#[2] "C:/Program Files/R/R-3.5.2/library"          
#[3] "D:/rpackage"

会发现新路径添加成功，但是排在最后一个，也就是说安装在这个路径下的包可以被调用，但默认还是安装在C盘的路径，而且是一次性的，如果你restart R会发现：

.libPaths()
#[1] "C:/Users/kingjie/Documents/R/win-library/3.5"
#[2] "C:/Program Files/R/R-3.5.2/library"

白改了，没保存啊。。。但这个方法适用于你临时发现安装R包路径不可写的报错。

方法二（推荐）

file.edit('~/.Renviron')

就会打开这个名为.Renviron的配置文件，在它的第一行输入：
R_LIBS_USER="D:/rpackage"
再次restart R

.libPaths()
#[1] "D:/rpackage"                       
#[2] "C:/Program Files/R/R-3.5.2/library"

你设置的路径也第一行咯，也就是默认路径。

参考：
https://stackoverflow.com/questions/15170399/change-r-default-library-path-using-libpaths-in-rprofile-site-fails-to-work
https://www.zhihu.com/question/38780819